Mikromacierz chromosomalny kontra kariotypowanie w diagnostyce prenatalnej AD 7
Na mikromacierzach zidentyfikowano 1399 próbek mających warianty liczby kopii; spośród nich 1234 (88,2%) sklasyfikowano jako typowe łagodne, w tym 26, w których płód był nosicielem (3 to delecje sulfatazy steroidowej [mikrosomalnej], genu izozymu S [STS] na chromosomie Xp22.31 u kobiet, 22 były delecjami młodocianego genu nephronophthisis [NPHP1] na chromosomie 2q13, a obejmowało delecję genów gamma sarkoglikanu i sacsin [odpowiednio SGCG i SACS] na chromosomie 13q12.12). Trzydzieści pięć wariantów liczby kopii, występujące u 35 spośród 3822 płodów (0,9%), dotyczyło z góry określonej listy patogennych wariantów liczby kopii. Spośród pozostałych 130 próbek, 36 (27,7%) zostało uznanych za łagodne przez genetyka klinicznego badania, a 94 zachowało klasyfikację o nieokreślonym znaczeniu i zostało orzeczone przez Komitet Doradczy ds. Klinicznych. Komitet uznał, że 61 z tych 94 (64,9%) miało wystarczające znaczenie kliniczne, aby zgłosić je uczestnikowi. Ogółem, w sumie 96 z 3822 próbek płodowych z prawidłowym kariotypem (2,5%, przedział ufności 95% [CI], 2,1 do 3,1) miało mikrodelecję lub powielenie znaczenia klinicznego. Przeanalizowaliśmy wyniki z analizy mikromacierzy w podgrupach kobiet z prawidłowymi kariotypami (tab. 3). W próbkach pochodzących od płodów z podejrzeniem wzrostu lub anomalii strukturalnych, 45 z 755 (6,0%, 95% CI, 4,5 do 7,9) miało klinicznie istotne wyniki dotyczące mikromacierzy, które nie zostały wykryte przy kariotypowaniu. W sumie 34 spośród 1966 kobiet bez USG zidentyfikowało anomalie, które były badane z powodu zaawansowanego wieku matek, miały prawidłowy kariotyp i klinicznie istotny wynik na mikromacierzy (1,7%, 95% CI, 1,2 do 2,4), podobnie jak 12 729 kobiet, które przebadały pozytywny wynik badania przesiewowego zespołu Downa (1,6%, 95% CI, 0,9 do 2,9). Powtarzające się warianty liczby kopii związane z autyzmem i zmianami neurokognitywnymi były stosunkowo rozpowszechnione w naszych seriach badań (Tabela w dodatkowym dodatku) 5; Wykryliśmy te warianty liczby kopii w 1,3% (51 z 3822) kariotypowo normalnych ciąż: 3,6% (27 z 755) z i 0,8% (24 z 3067) bez strukturalnych anomalii.
Dyskusja
Wykazaliśmy, że analiza mikromacierzy jest odpowiednikiem standardowej analizy kariotypu w diagnostyce prenatalnej wspólnych aneuploidii. Analiza mikromacierzy dostarczyła dodatkowych istotnych klinicznie informacji w 1,7% ciąż ze standardowymi wskazaniami do diagnozy prenatalnej (takimi jak zaawansowany wiek matki i pozytywny wynik badania aneuploidalnego) oraz w 6,0% przypadków z anomalią dotyczącą ultrasonografii. Dane te wskazują na korzyść z analizy mikromacierzy chromosomowych jako standardową część badań prenatalnych, mając na uwadze, że podobnie jak w przypadku kariotypowania, wykrywanie wariantów o niepewnym znaczeniu klinicznym stanowi wyzwanie dla poradnictwa i wywołuje lęk.
Zastosowaliśmy projekt macierzy, który zmaksymalizował wykrywanie dobrze scharakteryzowanych mikrodelementów i duplikacji, ale także oligonukleotydy reprezentujące regiony rozmieszczone w całym genomie w celu zidentyfikowania dodatkowej nierównowagi chromosomów
[przypisy: plastyka ud, mielopatia szyjna objawy, nfz skierowanie na leczenie uzdrowiskowe ]
[podobne: zespol reynauda, nerwiak zarodkowy, rak nabłonkowy ]